Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Resp18P47939 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Resp18P47939 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Resp18P47939 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Resp18P47939 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Resp18P47939 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Resp18P47939 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Resp18P47939 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Resp18P47939 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Resp18P47939 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Resp18P47939 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Resp18P47939 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms