Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HexaP29416 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HexaP29416 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HexaP29416 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HexaP29416 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HexaP29416 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexaP29416 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexaP29416 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexaP29416 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexaP29416 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexaP29416 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexaP29416 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HexaP29416 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HexaP29416 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HexaP29416 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HexaP29416 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HexaP29416 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HexaP29416 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HexaP29416 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HexaP29416 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HexaP29416 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HexaP29416 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexaP29416 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexaP29416 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexaP29416 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexaP29416 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexaP29416 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HexaP29416 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HexaP29416 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HexaP29416 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HexaP29416 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HexaP29416 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HexaP29416 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexaP29416 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexaP29416 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexaP29416 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexaP29416 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexaP29416 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HexaP29416 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HexaP29416 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HexaP29416 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HexaP29416 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HexaP29416 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HexaP29416 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HexaP29416 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HexaP29416 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HexaP29416 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HexaP29416 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HexaP29416 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HexaP29416 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HexaP29416 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HexaP29416 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HexaP29416 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HexaP29416 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HexaP29416 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
HexaP29416 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
HexaP29416 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
HexaP29416 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HexaP29416 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
HexaP29416 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
HexaP29416 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HexaP29416 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HexaP29416 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
HexaP29416 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HexaP29416 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HexaP29416 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
HexaP29416 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
HexaP29416 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
HexaP29416 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HexaP29416 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HexaP29416 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
HexaP29416 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HexaP29416 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
HexaP29416 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
HexaP29416 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HexaP29416 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HexaP29416 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HexaP29416 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HexaP29416 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HexaP29416 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HexaP29416 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
HexaP29416 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
HexaP29416 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HexaP29416 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms