Protein–RNA interactions for Protein: P16056

Met, Hepatocyte growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MetP16056 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
MetP16056 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MetP16056 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
MetP16056 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MetP16056 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MetP16056 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MetP16056 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MetP16056 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
MetP16056 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MetP16056 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
MetP16056 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
MetP16056 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MetP16056 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MetP16056 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MetP16056 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
MetP16056 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MetP16056 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MetP16056 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MetP16056 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MetP16056 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MetP16056 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MetP16056 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MetP16056 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MetP16056 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MetP16056 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MetP16056 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MetP16056 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MetP16056 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MetP16056 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
MetP16056 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MetP16056 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MetP16056 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MetP16056 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MetP16056 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MetP16056 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MetP16056 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MetP16056 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MetP16056 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MetP16056 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MetP16056 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MetP16056 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MetP16056 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MetP16056 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MetP16056 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MetP16056 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MetP16056 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MetP16056 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
MetP16056 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MetP16056 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MetP16056 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MetP16056 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MetP16056 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MetP16056 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MetP16056 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MetP16056 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MetP16056 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MetP16056 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MetP16056 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
MetP16056 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
MetP16056 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MetP16056 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MetP16056 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MetP16056 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MetP16056 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MetP16056 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MetP16056 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MetP16056 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MetP16056 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MetP16056 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
MetP16056 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MetP16056 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MetP16056 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MetP16056 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MetP16056 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MetP16056 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
MetP16056 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MetP16056 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MetP16056 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MetP16056 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MetP16056 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MetP16056 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MetP16056 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MetP16056 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MetP16056 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MetP16056 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MetP16056 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MetP16056 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MetP16056 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MetP16056 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MetP16056 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MetP16056 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MetP16056 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MetP16056 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MetP16056 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MetP16056 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MetP16056 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MetP16056 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MetP16056 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MetP16056 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MetP16056 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 300.8 ms