Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Dnmt3cP0DOY1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dnmt3cP0DOY1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Dnmt3cP0DOY1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms