Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxd3P09027 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hoxd3P09027 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxd3P09027 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms