Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
C4bP01029 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
C4bP01029 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4bP01029 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4bP01029 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
C4bP01029 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
C4bP01029 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4bP01029 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4bP01029 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
C4bP01029 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4bP01029 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4bP01029 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4bP01029 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4bP01029 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
C4bP01029 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4bP01029 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4bP01029 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4bP01029 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4bP01029 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4bP01029 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4bP01029 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
C4bP01029 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
C4bP01029 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4bP01029 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4bP01029 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
C4bP01029 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
C4bP01029 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4bP01029 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4bP01029 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4bP01029 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
C4bP01029 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
C4bP01029 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
C4bP01029 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4bP01029 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
C4bP01029 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4bP01029 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4bP01029 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4bP01029 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
C4bP01029 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
C4bP01029 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4bP01029 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
C4bP01029 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
C4bP01029 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4bP01029 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4bP01029 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4bP01029 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
C4bP01029 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
C4bP01029 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4bP01029 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4bP01029 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4bP01029 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4bP01029 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
C4bP01029 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4bP01029 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4bP01029 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
C4bP01029 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
C4bP01029 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
C4bP01029 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4bP01029 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
C4bP01029 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4bP01029 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4bP01029 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4bP01029 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4bP01029 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
C4bP01029 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4bP01029 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4bP01029 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4bP01029 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4bP01029 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4bP01029 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
C4bP01029 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
C4bP01029 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4bP01029 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4bP01029 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
C4bP01029 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4bP01029 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4bP01029 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4bP01029 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C4bP01029 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4bP01029 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C4bP01029 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4bP01029 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C4bP01029 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4bP01029 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C4bP01029 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C4bP01029 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4bP01029 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C4bP01029 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C4bP01029 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C4bP01029 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C4bP01029 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms