Protein–RNA interactions for Protein: O89084

Pde4a, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4A, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde4aO89084 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Pde4aO89084 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pde4aO89084 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Pde4aO89084 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pde4aO89084 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde4aO89084 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde4aO89084 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde4aO89084 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde4aO89084 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde4aO89084 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde4aO89084 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde4aO89084 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms