Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F11rO88792 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F11rO88792 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F11rO88792 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F11rO88792 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F11rO88792 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
F11rO88792 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
F11rO88792 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F11rO88792 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
F11rO88792 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
F11rO88792 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F11rO88792 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F11rO88792 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F11rO88792 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
F11rO88792 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F11rO88792 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
F11rO88792 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
F11rO88792 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
F11rO88792 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
F11rO88792 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
F11rO88792 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
F11rO88792 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F11rO88792 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F11rO88792 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F11rO88792 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F11rO88792 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F11rO88792 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
F11rO88792 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
F11rO88792 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
F11rO88792 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F11rO88792 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F11rO88792 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F11rO88792 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F11rO88792 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F11rO88792 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
F11rO88792 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F11rO88792 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F11rO88792 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F11rO88792 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F11rO88792 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
F11rO88792 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
F11rO88792 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F11rO88792 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F11rO88792 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F11rO88792 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
F11rO88792 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F11rO88792 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F11rO88792 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
F11rO88792 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
F11rO88792 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F11rO88792 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F11rO88792 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F11rO88792 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
F11rO88792 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
F11rO88792 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms