Protein–RNA interactions for Protein: O70589

Cask, Peripheral plasma membrane protein CASK, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CaskO70589 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CaskO70589 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CaskO70589 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CaskO70589 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CaskO70589 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CaskO70589 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CaskO70589 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CaskO70589 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CaskO70589 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CaskO70589 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CaskO70589 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CaskO70589 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CaskO70589 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CaskO70589 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CaskO70589 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CaskO70589 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CaskO70589 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CaskO70589 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CaskO70589 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CaskO70589 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CaskO70589 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CaskO70589 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CaskO70589 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CaskO70589 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CaskO70589 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CaskO70589 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CaskO70589 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CaskO70589 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CaskO70589 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CaskO70589 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CaskO70589 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CaskO70589 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CaskO70589 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CaskO70589 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
CaskO70589 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CaskO70589 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
CaskO70589 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CaskO70589 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CaskO70589 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CaskO70589 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CaskO70589 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CaskO70589 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CaskO70589 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CaskO70589 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CaskO70589 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CaskO70589 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CaskO70589 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CaskO70589 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CaskO70589 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CaskO70589 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CaskO70589 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CaskO70589 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CaskO70589 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CaskO70589 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CaskO70589 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CaskO70589 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CaskO70589 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CaskO70589 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CaskO70589 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CaskO70589 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CaskO70589 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CaskO70589 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CaskO70589 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CaskO70589 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CaskO70589 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CaskO70589 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CaskO70589 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CaskO70589 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CaskO70589 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CaskO70589 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CaskO70589 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CaskO70589 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CaskO70589 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CaskO70589 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CaskO70589 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CaskO70589 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CaskO70589 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CaskO70589 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CaskO70589 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CaskO70589 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CaskO70589 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CaskO70589 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CaskO70589 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CaskO70589 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CaskO70589 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CaskO70589 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CaskO70589 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CaskO70589 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CaskO70589 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CaskO70589 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CaskO70589 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CaskO70589 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms