Protein–RNA interactions for Protein: O54851

Gjd2, Gap junction delta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd2O54851 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gjd2O54851 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gjd2O54851 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gjd2O54851 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Gjd2O54851 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Gjd2O54851 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms