Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc4O35988 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sdc4O35988 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sdc4O35988 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sdc4O35988 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sdc4O35988 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sdc4O35988 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms