Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtgisO35074 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtgisO35074 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtgisO35074 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtgisO35074 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtgisO35074 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtgisO35074 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtgisO35074 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtgisO35074 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtgisO35074 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtgisO35074 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtgisO35074 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtgisO35074 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtgisO35074 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtgisO35074 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtgisO35074 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtgisO35074 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PtgisO35074 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PtgisO35074 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms