Protein–RNA interactions for Protein: O09127

Epha8, Ephrin type-A receptor 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha8O09127 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Epha8O09127 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha8O09127 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha8O09127 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Epha8O09127 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Epha8O09127 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha8O09127 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Epha8O09127 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Epha8O09127 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha8O09127 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Epha8O09127 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Epha8O09127 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha8O09127 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Epha8O09127 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms