Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ncoa3O09000 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ncoa3O09000 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ncoa3O09000 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncoa3O09000 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncoa3O09000 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Ncoa3O09000 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ncoa3O09000 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncoa3O09000 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms