Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem200cJ3QK46 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tmem200cJ3QK46 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tmem200cJ3QK46 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tmem200cJ3QK46 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms