Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lmod3E9QA62 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lmod3E9QA62 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lmod3E9QA62 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.51■■□□□ 1.68
Lmod3E9QA62 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod3E9QA62 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms