Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U0

Usp17lb, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein B, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lbE9Q9U0 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Usp17lbE9Q9U0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Usp17lbE9Q9U0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp17lbE9Q9U0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp17lbE9Q9U0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
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