Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Simc1E9Q6E9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Simc1E9Q6E9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Simc1E9Q6E9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Simc1E9Q6E9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Simc1E9Q6E9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms