Protein–RNA interactions for Protein: E9Q309

Cep350, Centrosome-associated protein 350, mousemouse

Predictions only

Length 3,095 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep350E9Q309 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cep350E9Q309 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cep350E9Q309 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cep350E9Q309 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cep350E9Q309 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cep350E9Q309 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms