Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ddx60E9PZQ1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ddx60E9PZQ1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ddx60E9PZQ1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ddx60E9PZQ1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ddx60E9PZQ1 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ddx60E9PZQ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
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