Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Abca16E9PWJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Abca16E9PWJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
Abca16E9PWJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Abca16E9PWJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Abca16E9PWJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Abca16E9PWJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Abca16E9PWJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms