Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gimd1E9PW74 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gimd1E9PW74 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gimd1E9PW74 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gimd1E9PW74 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gimd1E9PW74 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms