Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trim5E9PV98 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trim5E9PV98 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Trim5E9PV98 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trim5E9PV98 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trim5E9PV98 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms