Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm17333C6EQI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17333C6EQI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17333C6EQI3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm17333C6EQI3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms