Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PtpruB1AUH1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
PtpruB1AUH1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PtpruB1AUH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PtpruB1AUH1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PtpruB1AUH1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
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