Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F6

Ttll13, Tubulin polyglutamylase TTLL13, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll13A4Q9F6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ttll13A4Q9F6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Ttll13A4Q9F6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Ttll13A4Q9F6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Ttll13A4Q9F6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Ttll13A4Q9F6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Ttll13A4Q9F6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ttll13A4Q9F6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ttll13A4Q9F6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Ttll13A4Q9F6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms