Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FocadA2AKG8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FocadA2AKG8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FocadA2AKG8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FocadA2AKG8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
FocadA2AKG8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms