Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIP3

4933424G06Rik, RIKEN cDNA 4933424G06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933424G06RikA0A140LIP3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
4933424G06RikA0A140LIP3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
4933424G06RikA0A140LIP3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4933424G06RikA0A140LIP3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4933424G06RikA0A140LIP3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms