Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kif3aP28741 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms