Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Jag1Q9QXX0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Jag1Q9QXX0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Jag1Q9QXX0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Jag1Q9QXX0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Jag1Q9QXX0 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Jag1Q9QXX0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms