Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Higd1aQ9JLR9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Higd1aQ9JLR9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Higd1aQ9JLR9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms