Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJV4

Cacng4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng4Q9JJV4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacng4Q9JJV4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cacng4Q9JJV4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cacng4Q9JJV4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cacng4Q9JJV4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cacng4Q9JJV4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms