Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn19Q9ET38 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cldn19Q9ET38 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn19Q9ET38 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cldn19Q9ET38 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cldn19Q9ET38 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cldn19Q9ET38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cldn19Q9ET38 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cldn19Q9ET38 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cldn19Q9ET38 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.1 ms