Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
OtofQ9ESF1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OtofQ9ESF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OtofQ9ESF1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OtofQ9ESF1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OtofQ9ESF1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
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