Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ7

Rims2, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims2Q9EQZ7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Rims2Q9EQZ7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Rims2Q9EQZ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Rims2Q9EQZ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rims2Q9EQZ7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rims2Q9EQZ7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rims2Q9EQZ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rims2Q9EQZ7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms