Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem239Q9DA47 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem239Q9DA47 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem239Q9DA47 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms