Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8Z6

Atg101, Autophagy-related protein 101, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg101Q9D8Z6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Atg101Q9D8Z6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg101Q9D8Z6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg101Q9D8Z6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Atg101Q9D8Z6 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms