Protein–RNA interactions for Protein: Q9D742

Ap5s1, AP-5 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap5s1Q9D742 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap5s1Q9D742 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap5s1Q9D742 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ap5s1Q9D742 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ap5s1Q9D742 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms