Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gbe1Q9D6Y9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbe1Q9D6Y9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbe1Q9D6Y9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbe1Q9D6Y9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbe1Q9D6Y9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms