Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5W4

Ccdc81, Coiled-coil domain-containing protein 81, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc81Q9D5W4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc81Q9D5W4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccdc81Q9D5W4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc81Q9D5W4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccdc81Q9D5W4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc81Q9D5W4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms