Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cfap53Q9D439 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cfap53Q9D439 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cfap53Q9D439 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap53Q9D439 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms