Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Mrpl28Q9D1B9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Mrpl28Q9D1B9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Mrpl28Q9D1B9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Mrpl28Q9D1B9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.4 ms