Protein–RNA interactions for Protein: Q9D075

Trmt10b, tRNA methyltransferase 10 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt10bQ9D075 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trmt10bQ9D075 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trmt10bQ9D075 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trmt10bQ9D075 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trmt10bQ9D075 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trmt10bQ9D075 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms