Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Tspan1Q99J59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tspan1Q99J59 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tspan1Q99J59 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tspan1Q99J59 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms