Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD3

Tm4sf4, Transmembrane 4 L6 family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm4sf4Q91XD3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tm4sf4Q91XD3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Tm4sf4Q91XD3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tm4sf4Q91XD3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tm4sf4Q91XD3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tm4sf4Q91XD3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tm4sf4Q91XD3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms