Protein–RNA interactions for Protein: Q91WU4

Tmco4, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco4Q91WU4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tmco4Q91WU4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tmco4Q91WU4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tmco4Q91WU4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tmco4Q91WU4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmco4Q91WU4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tmco4Q91WU4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms