Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ3

Dkk4, Dickkopf-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk4Q8VEJ3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dkk4Q8VEJ3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dkk4Q8VEJ3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dkk4Q8VEJ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Dkk4Q8VEJ3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk4Q8VEJ3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk4Q8VEJ3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk4Q8VEJ3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk4Q8VEJ3 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Dkk4Q8VEJ3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Dkk4Q8VEJ3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms