Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3L8

Cdk8, Cyclin-dependent kinase 8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk8Q8R3L8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cdk8Q8R3L8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cdk8Q8R3L8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Cdk8Q8R3L8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cdk8Q8R3L8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cdk8Q8R3L8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms