Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Paf1Q8K2T8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Paf1Q8K2T8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Paf1Q8K2T8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Paf1Q8K2T8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Paf1Q8K2T8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms