Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF6

Wdr47, WD repeat-containing protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 920 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr47Q8CGF6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Wdr47Q8CGF6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdr47Q8CGF6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr47Q8CGF6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr47Q8CGF6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms